Sekvenční Chip protokoly

Sequential chromatin immunoprecipitation , známý jako SeqChIP , jebiologický test určený definovat způsob, jakým tyto dva proteiny interagují v rámci jednoho regionu kyseliny deoxyribonukleové ( DNA ) pramen . Vědci zapojit specifickou sadu objednaných úkolů, které odhalují tři možné vztahy mezi bílkovinami , které jsou posuzovány . Stejně jako u většiny vědeckých testů , to bytosti s čištěním a končí se závěrem . Podle vědců z Harvardu , technologický pokrok v analýze SeqChIP mohou umožnit vědcům šířeji studiu biologických jevů . Připravte

experimenty SeqChIP obsahovat pečlivou přípravu , aby bylo možné dezinfikovat a čistit magnetické kuličky pro experiment . Výzkumní pracovníci musí umýt korálků vícekrát a vyčistit v roztoku " bloku " . Korálky jsou pak pozastavena pro sušení a znovu prát . Obecně platí, že vědci nechat den před konečným praní , dříve než přistoupí k fázi propojení . Vzhledem k povaze různých DNA vlákna pro posouzení této fázi přípravy se také liší ve složitosti . Nicméně , jedna vědecká pravda zůstává :čističtest,čistšívýsledek
CrossLink

Vědci vyberte proteinové komplexy DNA , nebo oblasti v The Strand, pro zlepšení . s protilátkou . Ve skutečnosti , biologové juxtapose proteiny, aby bylo možné sledovat jejich interakci . Poté, co poznamenal , cross -link musí být potvrzena v obráceném pořadí . Myslíte , že proteiny stále vztahují -li sesekvence zvrátit? SeqChIP vědci se domnívají, žekoexistence obou proteinů při hodnocení v opačném směru poskytují přesvědčivý důkaz o úplné spolupráce obsazení , a umožnit jednoznačnou diferenciaci částečné obsazení a bez spolupráce obsazení .

Pomáhá

polymerázová řetězová reakce , nebo " PCR ", jeproces DNA amplifikace , která kontroluje kvalitu , nebo čistotu , DNA . PCR se provádí ve třech fázích . Za prvé , PCR taví vlákna od sebe zvýšením teploty . Pak vědci přinést dvě šablony prvky dohromady s PCR primery . Konečně , biologové inkubovat DNA tak, že polymerázy primery způsobit buňky v rámci vyšetření na clusteru . Odtud , vědci přejít na zkoumání klastrů .
Posoudit

analýza zkoumá DNA vlákna na přítomnosti nebo nepřítomnosti " obsazení ", interaktivní vztah mezi bílkoviny . Dva proteiny, které vždy spojují se stejnou DNA fragmentu mají kompletní co- obsazení , no co- obsazení nastane, když mohou proteiny pouze sdružují do vzájemně exkluzivní subpopulací řetězce DNA , částečné co- kapacita znamená, že některé molekuly DNA mají jak proteiny , zatímco jiní mají jedno nebo druhé . Pokud testování SeqChIP je postup v řetězci biologie , poskytuje vědcům s možností použití singulární výsledky celé genomové struktury .