Protokoly používané v QSAR

QSAR je zkratka pro vztah kvantitativní činnosti struktura . Používá se pro zobrazení , jakchemická struktura může být kvantitativně koreluje s konkrétní proces , QSAR se často používá pro navrhování léků a drog . Tato metoda se používá pro vedení chemické syntézy , protože existuje mnoho tisíce různých možných struktur pro jednu molekulu a vědci by jinak odpad spoustu času testováním každý strukturu . Statistiky hrají důležitou roli v metodice QSAR . Vícenásobná lineární regrese

Vícenásobná lineární regresní analýza se používá, když existuje několik studií použité , které jsou spojené s jednou konkrétní chemické struktury . Rovnice je vyvinut , že , například, může ukázat vztah mezi snížením velikosti nádoru a přítomnost hydrofobní skupinou, na čtvrté pozici fenylového kruhu . Tato analýza snižuje množství různých sloučenin , takževztah lze interpretovat pouze pomocíněkolika parametrů , které jsounejdůležitější .
Pattern Recognition

Rozpoznávání slouží k definování parametrů že výsledek , pokud jsou specifické chemické struktury seskupeny . Existuje několik různých typů analýz rozpoznávání , mezi něž patří analýza hlavních komponent , počítačového automatizovaného vyhodnocení struktury a automatizovanou analýzu dat pomocí technik rozpoznávání vzorů . Statistiky rozpoznávání použít původní data a bude korelovat různé struktury s biologickými výsledky na základě různých rozměrech , s nejvýznamnějším bytí v prvním vypočtené složky .
Srovnávací molekulární pole analýza

Tato verze QSAR má částečnou nejmenších čtverců analýzu spárovaný s křížovou validací pro vytvoření předpovědi pro biologickou aktivitu . V tomto typu metodiky , budevědec přiřadit konkrétní pravidla pro vyrovnání molekulární struktury . Každý z molekul se vejde do sítě a pak různé interakce se vypočítávají na základě interakcí z sondě atomem, na různých sítí . Existuje mnoho různých rovnic , které mohou mít za následek . Na rozdíl od jiných typů regrese , to produkuje rovnice , ve kterých jsou mnohem více parametrů než možných sloučenin
Apex - . 3D

Apex - 3D využívá systém, který automaticky vybírá nejlepší zarovnání a konformace pro struktury založené na potřebnou biologickou reakci z předchozích experimentů . Je možné odhalit vliv různých orientaci vazby , antagonistické aktivity proti agonistické aktivity a účinku různých receptorů . To vytváří 2D a 3D topografické matice a může generovat informace pro dvojice molekul , spíše než jednotlivé molekuly .
Genetická Funkce Sbližování

Genetická funkce přiblížení se používá, když je málo vzorky a mnoho různých proměnných, které jsou předmětem šetření , a pokud se datové soubory není lineární vztah . Používá nejlépe hodnocené modely a nejhůře hodnocené modely vypočtené z nezpracovaných dat . Staví lepší a lepší modely kvality tím, že nahradí nejhorší hodnocené modely . Mnoho různých vícenásobné spoje jsou pak poskytovány na vědce , který pak vybere finální model. Podobnosti mezi modely jsou studovány poskytovat informace o strukturálních a biologických souvislostí .