Jak analyzovat průtokové cytometrie dat
Průtoková cytometrie jeproces analýzy a počítání buněk a částic pomocí teorie rozptylu světla a světla buzení . Buňky jsou nuceni přes plášť jeden po druhém a projít paprskem laseru . Laser rozruší chemických látek v buňkách . Různé typy buněk vydávat různé typy světla . Optické detektory nebo čočky vyzvednout a měří světlo , světlo do přenos datového toku . Na základě analýzy dat , mohou technici přijít na distribuci buněk a pomáhají lékaři a vědci , aby rozhodnutí týkající se léčby . Návod dovolená 1
nastavit parametry cytometru . Každý cytometru je také počítačová komponenta, která přijímá světlo emitované z buněk a převádí množství a kvalitu světla dostupných dat . Vzhledem k tomu, že existují různé typy buněk , je zdevelké množství dat vytvořených . Nastavení parametrů údajů potřebných zpomaluje tok informací na zvládnutelné úrovni . Některé možnosti zahrnují nastavení úrovně napětí , nastavování laser pulsní parametry nebo nastavení světelného prahu .
2
Vyberte filtry na každé optické čočky . Filtry , že cut out specifické šířky pásma pro každý objektiv umožňujecytometr rozpoznat různé chemické vlastnosti každé buňky . To také umožňujecytometr rozpoznat , zda se světlo odráží rovně , jako přední rozptyl ( FS ), nebo v případě , že se odráží pod úhlem 90 stupňů v bočním rozptylem ( SS. )
3
Vyberte logaritmické nebo lineární akvizice . Akvizice Linear jenezpracovaná data , který je generován pomocí cytometru . Ukazuje typ buňky , nebo chemické složení buněk, které protékají laserového paprsku. Logaritmická funkce jde ještě o krok dále . Používá matematické funkce promítat další buňky, které nemusí být zjistitelné cytometru . Například , buňky mohou vykazovat chemickou sloučeninu, která jevedlejším produktem virové infekce . I přesto, že virus může být příliš malý, aby se detekován slabým proudem , budelogaritmická funkce předpokládají přítomnost viru na základě chemické složení buněk .
4
Vyberte jeden nebo dva parametry histogramy . Jedná se o typy grafů slouží k zobrazení údajů shromážděných cytometru . Jeden parametr histogram je vhodné v případě, že všechny údaje jsou vyneseny na ose " pozitivní" , což znamená, že všechny světla se odráží a měří . Snadný způsob, jak myslet na to , aby si představit, bar graf , s úrovní na levé a spodní části rámu . Informace je znázorněna mezi těmito dvěma parametry . Ale pro ty buňky, které absorbují rozdílné množství světla , se používádvou parametrů histogram . To umožňuje, aby údaje , které mají být vyneseny na obou pozitivní a negativní ose .