Výhody použití gelové elektroforézy
agarózovém gelu snadno vlije k použití a vzorky mohou být snadno obnovit . Gel je také vysoce upravitelné zvýšit vzdálenost mezi velkými a malými molekulami DNA . Vzhledem k tomu , že je vyrobena z cukru přítomného v mořských řas , agarózy je levnější než alternativy abezpečnější gel přípravek pro použití v elektroforézu .
Akrylamid Gel
jako agaróza , akrylamid je snadno modifikovat . S vyšší nosností , může běžet více vzorků současně . To je hlavní výhodou oproti agarózy je, že akrylamid je menší póry , takže je vhodnější pro separaci menších molekul DNA, které agarózovém gelu by neměly být schopny oddělit . Nicméně , bublání jevětší problém pro akrylamid , a , protože akrylamid jeneurotoxin , to může být velmi nebezpečné s ním pracovat.
Kapilární elektroforéza
Vzhledem k tomu, teplo odvádí rychle v polymeru , kapilární elektroforéza zabere méně času než gely , minut ve srovnání s hodin . Stejně tak , protože výsledky jsou elektronicky monitoroványcelý proces může být automatizován . Je však možné kapilární elektroforéza neběží tolik vzorků současně jako gely a stroje ( cena na více než 100.000 dolarů za jednotku ) a činidla stát podstatně více , než je metoda gelové oddělení , takže většina laboratoří nemají přístup k technologie .